Центърът реализира своята мисия в следните научни и приложни области:
- Хидродинамика на кораба
 - Океанско инженерство
 - Брегово инженерство и морска екология
 - Аеродинамика
 - Симулации и обучение
 - Морски и речни бедствия и катастрофи
 - Ефективност на водния транспорт
 - Съоръжения за риборазвъждане и аквакултури
 - Възобновяеми морски енергийни източници
 - Морски инженерен софтуер
 - CAD/CAM на модели за хидро- и аеродинамични експериментални изследвания
 
Центъра си поставя за цел:
– постоянно да усъвършенства качеството на научния продукт;
– адаптивност и гъвкавост на пазара на научните услуги;
– ефективно реализиране на научния продукт в условията на пазарна икономика;
– интегриране в глобалното научно пространство ;
– създаване на съвременни условия за обучение на студенти и докторанти по акредитирани професионални програми и специалности в съответствие със Закона за висше образование .
ПРЕДМЕТ НА ДЕЙНОСТ
Институтът осъществява своята мисия в следните научно-приложни области:
1. Хидродинамика на кораба, в т.ч.:
- ходкост, мореходност и маневреност на кораби в лабораторни и реални условия;
 - хидродинамично проектиране и оптимизиране на корабни форми и корабни движители, плаващи платформи и морски инженерни конструкции.
 
2. Океанско инженерство, в т.ч.:
- ходкост, мореходност и маневреност на плаващи океански технически съоръжения (конструкции);
 - статистика и прогнозиране на експлоатационните условия (вълнение, течения и вятър) в районите на опериране на корабите и океанските инженерни съоръжения;
 - технологии за преобразуване на океанската енергия;
 
– изследвания на катастрофи на кораби на море/реки и разработване и внедряване на системи за действия в условия на аварии;- изследвания на средства за утилизация на морската и речна енергия.
 
3. Информационни и числени технологии, в т.ч.:
- числени методи в механиката на флуидите;
 
– компютърно моделиране на процеси в хидро-и аеродинамиката;- информационни и управляващи бордови системи;
 - симулационни изследвания на управляемостта на корабите с използване на морски и речни тренажорни системи.
 
4. Аеродинамика, вт.ч.:
- аеродинамика на кораби, транспортни съоръжения, транспортни средства, летателни апарати
 - аеродинамика на инженерни съоръжения
 - аеродинамика на градски микрорайони, селища, промишлени сгради
 - устройства за измерване параметрите на въздушни течения
 - изследвания на средства за утилизация енергията на вятъра.
 
5. Хидродинамика и литодинамика на бреговата зона, в т.ч.:
- генериране и разпространение на ветрово вълнение и вълнови течения в бреговата зона
 - вълново въздействие върху брега и брегови инженерни съоръжения
 - динамика на наноси, изменение надънния релеф и бреговата линия.
 
6. Технологии за опазване и устойчиво развитие на околната морска и речна среда, в т.ч.:
- при инженерна намеса в бреговата зона
 - при замърсяване на крайбрежните води и наносите в резултат на индустриални дейности (воден транспорт, пристанищни дейности, туризъм), последствия от аварии и катастрофи
 - при хидродинамично въздействие на движещи се речни кораби и състави върху брега и дъното на реките
 - изследвания на рискови фактори и на наводнения в района на Долен Дунав.
 
7. Технологии на водния транспорт и транспортна телематика.
- изследвания на ефективността на морския/речния транспорт
 - разработване на интермодални транспортни схени за използуване водния път Рейн-Майн-Дунав.
 
8. Специални технологии за нуждите на отбраната.
- Проектиране и изследвания на средства за отблъскване на терористични акции в морските води на България
 - Изследване на бойни кораби с високи характеристики в сътрудничество с НАТО.
 
9. Теория и техника на моделния експеримент, технологии за изработване на модели, измервателни методи и средства, автоматизация на научните изследвания.
